โจ เฟแกน ทำงานอยู่เบื่องหลังความสำเร็จต่าง ๆ อย่างมากมายที่แอนฟิลด์ โดยไม่คาดคิดมาก่อนว่าจะต้องขึ้นมาเป็นผู้จัดการทีมในปี 1983 เมื่อต้องมาทำหน้าทีต่อจาก บ็อบ เพสลีย์[Bob Pailey] เริ่มต้นฤดูกาลแรกเท่านั้น โจ เฟแกน ก็สามารถพาทีมคว้าแชมป์ได้ถึง 3 แชมป์ ถือว่าเป็นสโมสรฟุตบอลแรกของประเทศอังกฤษ ที่ทำได้ทั้งแชมป์ดิวิชั่น1/แชมป์ลีก คัพ/แชมป์ยูโรเปี้ยน คัพ โจ เฟแกน ต้องพบกับความทุกข์ใจจนร้องเพลงไม่ออกและต้องตัดสินใจลาออกไปด้วยความเจ็บปวดกับกรณีโศกนาฏกรรมร้ายแรงที่ เฮย์เซลล์ [Heysel] ในปี 1985